Collaborateurs
Eduardo Rocha
L’équipe d’Eduardo Rocha est à la pointe de la génomique et de l’évolution microbiennes. Il a produit des outils de bioinformatique permettant d’identifier plusieurs types d’éléments génétiques mobiles et a joué un rôle clé dans l’étude de leur abondance dans les génomes bactériens et de leurs effets sur l’évolution bactérienne. Professeure Le Roux est actuellement engagée dans un projet financé par l’Agence Nationale de la Recherche (ANR) (« RESISTE » 2021-25).
Didier Mazel
Professeure Le Roux a animé un petit groupe de recherche au sein du laboratoire de Didier Mazel de 2004-2008. Ce laboratoire explore les transfert horsizontaux chez les bactéries, leurs mécanismes et leur impact évolutif. Pr Le Roux co-supervise aujourd’hui un étudiant de doctorat (Baptiste Darracq, 2022-25) avec Dr Céline Loot, sur un sujet visant à caractériser les éléments de défense contre les phages dans l’intégron chromosomique de V. cholerae.
Marc Monot
Marc Monot dirige la plateforme Biomics de l’Institut Pasteur, structure dédiée au séquençage de nouvelle génération qui propose des technologies de séquençage long-read et short-read. L’optimisation du séquencage de grande collection de vibriophages a été réalisée par leur soins.
Zoë Chaplain
Zoë nous aide avec la divulgation et la promotion d’événements en utilisant ses compétences en tant que graphiste.
Alexander Harms
https://ifnh.ethz.ch/research/molecular-phage-biology.html
Nous collaborons avec le groupe d’Alexander, en particulier avec Damien Piel (chercheur postdoctoral dans le laboratoire de Harms), en utilisant la remarquable collection de Bâle afin d’explorer plus en profondeur les mécanismes de nos systèmes anti-phages dans un contexte génétique plus naïf.
Jose Penades
https://profiles.imperial.ac.uk/j.penades/about
Nous collaborons avec José et les membres de son groupe, notamment Wang Jinlong et Liu Mei, sur plusieurs aspects liés à la génétique et à la structure des phages et de leurs satellites. Ses travaux pionniers et sa passion pour les satellites de phages continuent d’inspirer une grande partie de nos recherches.
Tiago Dias Da Costa
https://profiles.imperial.ac.uk/t.costa
En collaboration avec Tiago, nous explorons le monde de la cryo-microscopie électronique (cryo-EM), obtenant ainsi une vue fascinante et détaillée de nos minuscules phages.
Melanie Blokesch
https://www.epfl.ch/labs/blokesch-lab
Nous entretenons une collaboration de longue date avec Mélanie sur les Vibrio environnementaux et, plus récemment, sur leurs phages, un partenariat renforcé par le mini-sabbatique particulièrement agréable de F. Le Roux à l’EPFL (été 2018) ainsi que par les visites de Mélanie à Roscoff et à Montréal.