Financiación
Canada Excellence Research Chairs (CERC), Eco-Evo-Patho de microbios en la naturaleza ($8 000 000)
Este programa tiene como objetivo explorar el origen, la propagación y la evolución de genes de resistencia a los antimicrobianos en poblaciones naturales de bacterias. Usaremos bacterias patógenas de ostras, Vibrios, como sistema modelo. Nos beneficiamos de una colección única de 1200 bacteriófagos y 600 huéspedes bacterianos, aislados y secuenciados durante proyectos anteriores, para desarrollar un enfoque que integre la observación de campo y la genética de laboratorio. Exploraremos la diversidad y evolución de los mecanismos de resistencia a antibióticos y metales pesados. Buscaremos comprender la heterogeneidad del tamaño del genoma en poblaciones naturales de Vibrio. Finalmente, identificaremos las bases genéticas, mecanicistas y evolutivas de las interacciones fago-vibrio en la naturaleza.
El Proyecto Filantrópico, ofreció una financiación de CAD$1 500 000.
Este proyecto apoya una ambiciosa iniciativa que aprovecha tecnologías avanzadas y métodos de inteligencia artificial (IA) de la Universidad de Montreal (UdeM) en colaboración con la Facultad de Medicina de la UdeM y el Instituto Pasteur. Esta iniciativa internacional es pionera en soluciones de vanguardia para hacer frente a los retos de la resistencia a los antimicrobianos (RAM) mediante la formación de la próxima generación de científicos, el desarrollo de nuevos antibióticos y la exploración de enfoques alternativos como la terapia con bacteriófagos. La estrategia se basa en dos ejes principales para aumentar las tasas de éxito. En primer lugar, los métodos avanzados de detección analizan rápidamente los compuestos químicos, como si se tratara de una «autopsia bacteriana», e identifican las propiedades capaces de combatir las bacterias resistentes a los antibióticos. Esta información sirve de base a un modelo de inteligencia artificial para predecir rápidamente posibles antibióticos, lo que acelera el descubrimiento de medicamentos esenciales más allá de los métodos convencionales. Al mismo tiempo, el proyecto investiga los factores que aumentan la eficacia de los bacteriófagos contra los patógenos, lo que es crucial para desplegarlos como una nueva arma contra la RAM y aliviar la carga del sistema sanitario. La integración de estos enfoques tiene como objetivo identificar compuestos que aumenten la eficacia de los bacteriófagos contra los patógenos de la RAM, ofreciendo una solución integral para combatirla.
Fundación Canadiense para la Innovación (CFI) Fondo de Líderes John R. Evans, Eco-Evo-Patho de microbios en la naturaleza, $200 001 (presupuesto total de $516 467)
El objetivo de este programa de investigación es explorar cómo los fagos controlan las bacterias patógenas en la naturaleza y evaluar si es posible utilizarlos como herramientas terapéuticas. El trabajo propuesto es innovador porque combina ecología y evolución microbiana, infectiología, genética de fagos y bacterias para explorar en “tiempo real” la evolución de estos microbios. Para lograr este programa de investigación, el CFI proporcionará fondos para 1) un sistema de cuantificación de PCR digital en gotas (ddPCR) que permite una evaluación altamente sensible de ADN y ARN en muestras ambientales raras; 2) un conjunto de equipos esenciales para experimentos con miles de microorganismos aislados del medio ambiente.
Proyecto IVADO (CAD$100 000)
Nuestro objetivo es dilucidar los mecanismos de coevolución examinando las defensas bacterianas, cuantificando las interacciones de infección cruzada y analizando los genomas accesorios de los fagos. Mediante este enfoque, pretendemos descubrir una amplia gama de sistemas antidefensa empleados por los fagos. Con financiación del IVADO, sintetizaremos más de 200 sistemas antidefensa putativos y evaluaremos su funcionalidad en contextos dependientes e independientes de los fagos. Este esfuerzo de investigación contribuirá significativamente a nuestra comprensión de las interacciones huésped-fago y la evolución de los mecanismos de defensa.